Per apportare modifiche a tutte le sezioni del progetto, ad eccezione degli usi, è necessario passare alla "modalità di modifica". In modalità di modifica non è possibile spostarsi da un elemento all'altro o da una fase all'altra e i calcoli relativi alle modifiche apportate vengono visualizzati solo dopo aver salvato e abbandonato la modalità di modifica.
In modalità di modifica, è possibile annullare e ripetere le azioni intraprese. È possibile annullare le modifiche e uscire dalla modalità di modifica, oppure salvare le modifiche e uscire dalla modalità di modifica. Dopo il salvataggio e l'uscita dalla modalità di modifica, la cronologia delle azioni annullate e rifatte verrà eliminata in modo permanente.